針對人工濕地污水處理系統對氮磷的去除效果不穩定以及系統的滲透性能在運行過程中會有所下降等問題，眾多學者對填料進行了改良，并發現了對污染物具有特異性去除能力的填料。

目前填料改良主要從3個方面進行:①向填料中添加適量的改性材料，如沸石濾料、陶粒濾料、有機質濾料、生物炭濾料、粉煤灰濾料、火山巖濾料、蛭石濾料、石灰石濾料、改性填料及鋼渣等吸附能力強、比表面積大以及通透性好的基質材料；②優化不同填料間的組合及配比，在傳統自然土壤的基礎上，選擇添加吸附能力強、多種滲透性好的基質，如沸石、石英砂、給水廠污泥等，組成混合填料，可以是質量比也可以是體積比；③設計成多層填料，可以是雙層，也可以是3層，甚至可以是3層以上，多層設置既可以增加滲透速率，降低發生堵塞的風險，也可以提升系統凈化能力。

目前，對填料的研究主要集中在不同種類填料對不同污染物的凈化效果，而對于填料間的組合應用的效果尚缺乏深入的研究，未形成統一的設計規范。由于中國各地區的土壤類型、地質條件不同，污水水質特點也不同，即使使用相同的填料及組合配比的情況下取得的凈化效果也不一定相同。因此，應根據當地的實際情況，深入研究人工濕地污水處理系統適宜的填料類型及組合配比，使其能高效發揮對污染物的凈化效果，這是該技術在中國推廣應用的關鍵問題。